2015-09-01から1ヶ月間の記事一覧
普段、Windows10が入ったノートパソコンを利用していて、解析を行うためにLinuxの入ったデスクトップパソコンを使うことがあります。 恥ずかしい話ですが、今までデータのやり取りをパソコン間で行うために、外付けのハードディスクを使って行っていました。…
CentOSを利用していたとき、CPU・メモリの負荷状態を視覚化するツールが常駐しており、今どれくらいの負荷状態にあるか確認できて便利だなぁと感じていました。 UbuntuやBioLinuxではそのような可視化ツールは入っていないので、適当なツールを導入したいと…
BioLinux8はLinuxディストリビューションであるUbuntu14.04をベースにつくられており、あらかじめバイオインフォマティクス解析用のソフトウェアがインストールされているから初心者向きだと聞きますが、思わぬ落とし穴があったので紹介します。 Ubuntu14.04…
BioLinux8は、Linuxのディストリビューションの1つであるUbuntu14.04をベースに作られたバイオインフォマティクス解析に特化したLinux OSです。 <a href="http://environmentalomics.org/bio-linux/" data-mce-href="http://environmentalomics.…
最近Pythonを使って、特定のmicroRNAが結合するSeed配列をmRNAの配列中から探索して、さらに種間保存性や配列の特徴を解析するスクリプトを思いつくままに書いたのですが、 実行してみて、そのスクリプトがやたら遅いことに気づきました(-_-;) 「1つのmiRNA…