NGS
BioLinux8は、Linuxのディストリビューションの1つであるUbuntu14.04をベースに作られたバイオインフォマティクス解析に特化したLinux OSです。 <a href="http://environmentalomics.org/bio-linux/" data-mce-href="http://environmentalomics.…
miRBaseは言わずと知れたmiRNAのデータベースですが更新のペースが早く(近年では年一回ペースと落ち着いている)、登録されているmiRNAのレコードが変更されたり、削除されることもしばしばです。 アクセッション番号はもちろん変更されることなく普遍的な…
ecSeq Bioinformaticsで紹介されていたNGS解析用マッピングソフトの性能比較に関する記事を読んだので、内容をまとめておこうと思います。 結論から言って、ecSeq Bioinformaticsが出しているデータを見る限り、単純な性能だけで見ると、 RNA-seqでは「STAR…